Характерной особенностью современного развития Кыргызстана является его стремление к интеграции, как в мировое пространство, так и к интеграции внутри центрально-азиатского региона. Общие экологические и экономические проблемы единого природного региона способствуют принятию совместных и согласованных действий от всех стран Центральной Азии.

Созданы и функционируют региональные структуры: Международный фонд спасения Арала (МФСА) и при нем Межгосударственная Комиссия по устойчивому развитию (МКУР) с Научно-информационным центром (НИЦ МКУР).

На Межгосударственную Комиссию по устойчивому развитию (МКУР) возложена координация и управление региональным сотрудничеством в области охраны окружающей среды и устойчивого развития стран Центральной Азии. Руководство МКУР осуществляется министрами охраны окружающей среды стран Центральной Азии на основе двухлетней ротации. С июня 2007 года полномочия Председательствования МКУР перешли от Туркменистана к Кыргызской Республике.

За время председательствования Кыргызской Республики в МКУР проведено 4 заседания МКУР. 20-21 июня 2007 года в г.Бишкек состоялось первое заседание МКУР, на котором полномочия председательствования МКУР переданы Кыргызской Республике, 27 ноября 2008 года проведено заключительное в Кыргызской Республики заседание МКУР. В 2009 году председательствование в МКУР перейдет от Кыргызской Республики Республике Узбекистан согласно ротации.

В рамках деятельности МКУР, при поддержке ЮНЕП разработан и одобрен Региональный план действий по охране окружающей среды Центрально-Азиатских республик (РПДООС ЦАР). В реализацию РПДООС разработана и подписана в 2006 году Рамочная Конвенция «Об охране окружающей среды для устойчивого развития в Центральной Азии», подписаная тремя государствами Центральной Азии: Кыргызской Республикой, Республикой Таджикистан и Туркменистаном.

В 2006 году при поддержке ЮНЕП проведены оценочное исследование по приоритету РПДООС - управление отходами и исследования по Атмосферному Коричневому Облаку.

В рамках МКУР создан Региональный Горный Центр Центральной Азии с месторасположением офиса в г. Бишкек.

Сотрудничество со странами Центрально-Азиатского региона осуществляется также в рамках Соглашений между Правительствами Республики Казахстан, Кыргызской Республикой и Республикой Узбекистан о сотрудничестве в области охраны окружающей среды и рационального природопользования, а также в области сохранения биологического разнообразия (1998 г.).

Так же, образован Центрально-Азиатский Региональный Экологический Центр (РЭЦ ЦА), целью которого является укрепление и координация действий в области экологии между центрально-азиатскими республиками, а также привлечение внимания общественности к проблемам окружающей среды. С 2001 года в г. Бишкек функционирует филиал РЭЦ ЦА.

Решение вопросов по развитию регионального партнерства в области социально-экономического развития строятся на основе Договора о создании Единого Экономического пространства между Республикой Казахстан, Кыргызской Республикой, Республикой Таджикистан, Республикой Туркменистан и Республикой Узбекистан - «Центрально-Азиатское Экономическое Сообщество» (ЦАЭС), подписанного в 2000 году главами 5 государств. Кыргызстан входит в Таможенный союз стран СНГ, ШОС, а также принимает активное участие в Евразийском Экономическом Сообществе (ЕврАзЭС). В рамках этой организации рассматриваются вопросы по согласованию торгово-экономической деятельности, как страна ВТО осуществляет взаимодействие в ее рамках, ведет подготовку проектов годовых бюджетных посланий и др.