Организационная структура экологического мониторинга в Кыргызской Республике, начиная с момента своего создания, была в значительной степени раздроблена. Различные функции мониторинга выполняют несколько различных министерств и ведомств, которые можно разделить на три основные части:

• мониторинг состояния окружающей среды;

• мониторинг воздействия на окружающую среду природных и антропогенных факторов;

• сбор, обработка, анализ данных и принятие решений (или конструирование решений для управляющих органов).

Основными организациями и учреждениями, выполняющими мониторинг состояния окружающей среды и/или воздействия на окружающую среду, являются: Государственное агентство по охране окружающей среды и лесному хозяйству при Правительстве Кыргызской Республики, Министерство экологии и чрезвычайных ситуаций, Министерство здравоохранения, Министерство сельского и водного хозяйства и перерабатывающей промышленности, Государственное агентство по геологии и минеральным ресурсам и др.

В республике функционируют следующие системы мониторинга:

Организационная структура экологического мониторинга в Кыргызской Республике, начиная с момента своего создания, была в значительной степени раздроблена. Различные функции мониторинга выполняют несколько различных министерств и ведомств, которые можно разделить на три основные части:

• мониторинг источников антропогенных воздействий (Управление экологического мониторинга Государственного агентства по охране окружающей среды и лесному хозяйству при Правительстве КР) ;

• мониторинг животного и растительного мира, включая лесные ресурсы (Государственное агентство по охране окружающей среды и лесному хозяйству при Правительстве КР) ;

• мониторинг землепользования ( Бишкекское городское управление по землеустройству и регистрации прав на недвижимое имущество) ;

• мониторинг геологической среды и грунтовых вод (Государственное агентство по геологии и минеральным ресурсам) ;

• мониторинг сельскохозяйственных угодий (Министерство сельского и водного хозяйства и перерабатывающей промышленности) ;

• мониторинг водных ресурсов (Департамент водного хозяйства Минсельводхоз и перерабатывающей промышленности) ;

• мониторинг за изменением состояния окружающей природной среды (Главное управление по гидрометеорологии МЭиЧС КР) ;

• мониторинг за состоянием хвостохранилищ (Департамент мониторинга, прогнозирования чрезвычайных ситуаций и обращения с хвостохранилищами МЭиЧС КР) .

• мониторинг воздействий факторов среды обитания на здоровье населения (Департамент санитарно-эпидемиологического надзора Министерства здравоохранения) ;

• внутриведомственный мониторинг воздействия хозяйствующих субъектов на окружающую среду в различных отраслях промышленности.

Отдельная информация, имеющая непосредственное отношение к окружающей природной среде и рациональному природопользованию , накапливаемая и регулярно обновляемая, имеется также в Министерстве промышленности, торговли и туризма КР, Министерстве транспорта и коммуникаций КР, Министерстве обороны КР, Министерстве труда и социальной защиты КР, Министерстве экономики и финансов КР, Государственном таможенном комитете КР, Государственной инспекции по энергетике и газу, Национальном агентстве по антимонопольной политике и развитию конкуренции, Государственной инспекции по стандартизации и метрологии КР, Государственном агентстве по архитектуре и строительству при Правительстве КР, Национальной Академии Наук КР, предприятиях ЖКХ и др.

Параллельно с общереспубликанской системой мониторинга состояния окружающей среды существует система ведомственного экологического мониторинга, т.е. мониторинга, выполняемого силами предприятий и ведомств.

Национальным статистическим комитетом осуществляется сбор информации об объемах сбросов, выбросов, размещения отходов, состоянии природных ресурсов и др. по установленным статистическим формам отчетности.

Фактически в республике нет государственных органов, анализирующих экологическую информацию в комплексе, с целью выработки решений или рекомендаций в области экологической политики, как собственно и отсутствует централизованная база экологической информации и механизмы управления экологической ситуацией.

В настоящее время Кыргызстан сталкивается с многочисленными трудностями в поддержании и улучшении системы экологической информации. Отсутствует единая национальная система мониторинга. Практически не ведется необходимый мониторинг в таких важных сферах, как опасные отходы, тяжелые металлы, питьевая вода, грунтовые воды, отсутствует учет опасных отходов, которые сбрасываются на обычные наземные свалки (особенно в сельской местности) или складируется на предприятиях.

На предприятиях проводится самостоятельный контроль, но есть проблемы в достоверности данных, так как лаборатории зачастую не аттестованы.

Основными задачами Управления экологического мониторинга (УЭМ) Государственного агентства по охране окружающей среды и лесному хозяйству при Правительстве КР являются осуществление систематических наблюдений за состоянием окружающей среды и источниками антропогенного воздействия на нее.

В настоящее время из 7 областных управлений охраны окружающей среды экологические службы мониторинга имеются только в 3 областях.

Действующие службы экологического мониторинга аккредитованы в Национальной системе аккредитации на проведение исследований состояния объектов окружающей среды, а так же промышленных выбросов и сточных вод.

Оценка качества атмосферного воздуха и промышленных выбросов проводится по 12 показателям, поверхностных и сточных вод – по 28, почвы – по 20. УЭМ определяет уровень радиоактивности по гамма-фону окружающей среды.

Для улучшения совместимости измерений, доступности, качественного интегрированного анализа данных необходимо создание Национальной системы экологического мониторинга.